‘Huellas de desaparición’ es el resultado de la colaboración entre la Comisión de la Verdad y el grupo de investigación Forensic Architecture. Esta alianza es única en el ámbito internacional y pionera en la historia de las comisiones de la verdad porque articula el esclarecimiento de violaciones de derechos humanos con metodologías de investigación visuales y tecnológicas.
La alianza se ha enfocado en dos casos: en los mecanismos y patrones del despojo de tierras en la región bananera del Urabá antioqueño y en la infraestructura y logística de la desaparición forzada en el caso del Palacio de Justicia. Además, se ha realizado un tercer trabajo para visualizar y reconocer el impacto a los territorios indígenas de la Amazonía, en particular al pueblo nukak en Guaviare.